2.首次發酵。發酵分兩個階段進行。第壹次是從發酵開始到10 ~ 15天。應加強保溫保濕措施，促進發酵產物的糖化。經過5 ~ 7天的發酵，當發酵溫度達到45 ~ 50℃且發酵產物表面出現白色菌絲時(需2天以上)，第壹次會發生翻轉、倒置。然後繼續發酵，進入第二個發酵期(二次倒置)。
3.二次發酵。註意發酵產品的含水量壹般控制在60%左右。當含水量不足時，可完全補充5%尿素溶液，然後適當增加沈澱厚度，繼續發酵。65℃兩周後，60℃三周後，基本可以停止發酵。
發酵結束後，將發酵好的物料烘幹，使含水量達到40±5%，裝袋，存放在通風幹燥的地方。
擴展數據:
菜籽餅肥的正確施用方法:發酵後的菜籽肥與堆肥、糞肥混合用作基肥，也可以單獨用作追肥。據測定，菜籽餅肥用作追肥時，肥效穩定持久，效果優於化肥，且有後效？
菜籽餅肥可以充分粉碎後直接開溝施用，但要註意與作物幼苗保持適當的距離。菜籽餅肥直接施入時，因其本身的香味容易吸引地下害蟲，所以要摻入適當的農藥進行防治。
菜籽餅是壹種優質的有機肥料，具有很高的氮、磷含量。當它作為最大肥料使用時，肥效平衡持久，效果優於成本。目前菜籽餅等餅肥壹般都是加入好的旺農有機肥發酵劑堆積分解發酵，發酵過程中產生的大量熱量可以清理有害細菌，殺死蟲卵。