濟寧博物館收藏的漢碑在國內獨樹壹幟，享有“天下漢碑半濟寧”的美譽。全國現存漢碑僅有60塊，濟寧有38塊，其中博物館藏石11塊。這些銘文原本散落在濟寧文廟的院子裏，損毀嚴重。民國十八年，教育局長王大樹等人遷至漢北博物館，並保存至今。如景俊碑、鄭谷碑、吳榮碑、魯君碑的收藏都是漢碑的代表作，對研究漢代歷史和書法藝術具有重要意義。
在博物館收藏的其他文物中，許多都是珍品。比如春秋時期的雕刻工具，包括刀、鑿、針、鑿等27件，是目前國內唯壹壹套保存完好的雕刻工具；春秋時期的另壹件寶物是壹套完整的青銅禮器，包括7個鼎、1陪侍鼎和6個簧片。是奴隸主用來吃飯、待客、祭祀的器具；據說該館從民間收藏的北宋雕版印刷卷軸，是壹部至今無人了解的“天書”，具有重要的研究價值；可以稱之為“鎮館之寶”的元代貼花裸胎龍紋龍泉盤，更是令人嘆為觀止。這個直徑只有20厘米的瓷盤，色澤翠綠，光亮潤澤，裏面的壹對龍雕刻精細，栩栩如生，顯示了中國古代人民的精湛工藝。