湖北省不允許使用通行費專用發票抵扣增值稅。這是因為電子發票是唯壹可以抵扣的發票形式。收費公路通行費增值稅電子普通發票，即收費公路電子發票，旨在降低物流業成本，提升車主對收費公路服務的體驗。雖然全國範圍內取消了高速公路的省界收費站，電子發票也在逐步取代紙質發票，但這並不意味著紙質發票已經完全失去了使用價值，在其他情況下仍然可以使用。
車輛通行費稅收政策:
1.車輛通行費的性質:車輛通行費是指車輛在使用收費公路、橋梁、隧道等交通設施時，按照規定標準繳納的費用；
2.稅收政策:根據我國稅法，車輛通行費不屬於扣稅範疇；
3.發票的用途:車輛通行費專用發票通常用於財務核算和費用報銷，但不具備增值稅發票的屬性，不能用於增值稅抵扣；
4.扣稅條件:壹般來說，只有符合中華人民共和國國家稅務總局要求的增值稅專用發票或普通發票才能用於增值稅進項稅額抵扣。
綜上所述，湖北省的車輛通行費專用發票是不能抵扣的，因為只能識別電子發票抵扣，而湖北省的增值稅是不允許抵扣的。雖然電子發票正逐漸取代紙質發票，但紙質發票在其他情況下仍有價值。
法律依據:
關於收費公路通行費增值稅抵扣有關問題的通知
壹個
對增值稅壹般納稅人繳納的路橋、大門通行費，以取得的通行費發票(不含財政票據，下同)上註明的通行費金額為依據，按照以下公式計算可抵扣進項稅額:高速公路通行費可抵扣進項稅額=高速公路通行費發票上註明的金額除以(1加3%)乘以3%。壹級公路、二級公路、橋梁、閘門通行費可抵扣進項稅額=壹級公路、二級公路、橋梁、閘門通行費發票上註明的金額除以(1加5%)乘以5%。