牯牛降山區由於漫長的成陸歷史和復雜的地形變化，至今仍能發現大量約7000萬至200萬年前曾生活在第三紀和第四紀早期的古老動植物物種。如:杉木、紅豆杉、三尖杉等。，而銀杏是著名的“活化石”。牯牛降包含了大量的生物物種。據不完全統計，有植物230科726屬1348種，其中國家重點保護的植物13種，動物29種。此外，這裏還有許多爬行動物，包括超過26種的蛇，因此被稱為“蛇的王國”。
正是由於復雜的自然條件、豐富的生物資源和完好的生態系統，牯牛降成為了“華東動植物基因庫”，被生態學家稱為“綠色自然博物館”。
在牯牛降的密林中，還有壹個喧鬧繁華的動物世界，梅花鹿、蘇門羚、黑麂、雲豹、獼猴、果子貍、水獺、白鷴、白尾雉、鴛鴦、貓頭鷹等被列為國家重點保護。各種森林鳥類和青蛙資源也很豐富。這裏也是蛇的王國，第壹次調查就發現了38種，國內罕見。
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