同治三年(1864)，新疆庫車爆發大規模農民起義。起義軍壹度推翻清政府的地方統治，在當地有重要影響的熱西丁、卓被推選為首領，取得領導權，在庫車建立“汗卓”政權，成為當時新疆最大的割據勢力。
1865年，英國支持的侵略者中亞廣大汗國阿骨打入侵新疆。熱西丁和卓奮起反抗侵略者，多次組織西征驅逐他們，但都失敗了。1867阿古博攻殺並取代了雷西丁汗政權。1871年，俄國趁機出兵占領了作為新疆軍事政治中心的伊犁地區，加緊與英國爭奪中國西北邊境。直到1878年清軍收復新疆，才徹底粉碎了英俄利用阿古柏肢解侵吞中國西北領土的圖謀。
在可汗和卓政權的三年時間裏，熱西丁先後在庫車和阿克蘇鑄造了以其姓氏命名的雙面古回鶻幣，這是中國錢幣的典型範疇，也表明了熱西丁可汗堅決反對外來侵略的決心。