雙頭蛇屬於同卵雙生，發育過程中由於環境等因素的影響形成畸形卵。也可能是蛇的基因(控制頭部的部分)不穩定，容易發生變異，也就是變異蛇。可以初步斷定，雙頭蛇屬於同卵雙生，由於環境等因素的影響，在其發育過程中形成了畸形胎兒。過度使用化學品、農藥、化肥等環境汙染都可能導致這種基因突變。
大部分雙頭蛇因為身體結構與正常物種不同，只能存活5天到1周。已知最長的雙頭蛇:17。