玉米種子發紅是玉米本身的基因變化造成的，不存在與高粱雜交的可能。玉米是自花授粉植物，即使種上優良品種，也會退化變異。也就是說，妳現在用紅玉米做種子，因為可能已經有黃色的玉米花粉了，以後種出來的玉米可能又是黃色的(當然有的會保留紅色的特性)。
要想壹年四季都得到紅玉米，除了采集紅玉米做種子外，還要在玉米抽穗開花的時候把雌穗包起來，不讓非紅玉米的雄蕊花粉給紅玉米授粉。當紅玉米的雄蕊成熟時，采摘它的雄蕊，給雌穗授粉，這樣保證後代出紅玉米的概率更高。
以前市場上有糯紫玉米，但過幾年栽培出來就會有紫黃相間種子混合的玉米，其優良性狀會慢慢喪失，這是雜交的結果。