館內有固定的陳列，如鄭板橋生平及其藝術成就、施耐庵文物史料、興化名人史料、呂厚民攝影藝術博物館、南蕩出土文物等，常年對外開放。此外，還不定期舉辦臨時展覽。
鄭板橋是清代揚州八怪的代表人物和興化籍著名歷史人物，其書畫作品豐富，構成了興化市博物館館藏的壹大特色。
興化市博物館收藏的唐宋銀錠對研究中國貨幣特別是銀元的發展史具有重要價值。
興化文廟中的儒家禮器，明清以後的禮器齊全，品種齊全，內涵豐富，做工精美，全國罕見，是我國古代儒家文化教育的重要歷史見證。
《水滸傳》作者施耐庵家族墓出土文物是興化博物館的獨特文物。其中石公亭左墓誌是當代研究中最重要的文物，壹直受到學術界和社會的關註。
興化市博物館還收藏了當代著名書畫家的作品，其中大部分珍藏和頌揚了國內外著名書畫家鄭板橋的作品。隨著時間的推移，它們的價值會越來越明顯。