庫房是明代遺留下來的建築， 建造時間無考。其在明代的用途，壹說是文淵閣舊址，壹說是內承運庫所在。清入關後改稱內閣大庫，辟為收藏中央政府和宮廷重要檔案和其他文獻資料的庫房。
總建築面積1295平方米，磚木結構，外包磚石，不露木植，庫頂復以黃瓦，為磚城式建築。門窗以鐵皮包裹，窗中裝有鐵欄以防盜，窗開不闔利於通風,穴窗防塵,但室內梁柱、樓板、樓梯等均為木質，不利防火。
內閣大庫分紅本庫(俗稱西庫)和實錄庫(俗稱東庫)兩座庫房。紅本庫主要庋藏清入關後自順治起歷朝每年六科繳回的紅本 (即經內閣閱批的題本);實錄庫主要收儲明代檔案、滿文老檔、實錄、聖訓、起居註、史書、敕書、詔書、表章、輿圖、黃冊、鄉試錄、各種書籍等。