2.甜瓜充分膨大後，在第壹次標記的植株中，選擇健康無病、瓜型大小適宜、瓜型和皮色符合該品種原有特征的植株，進行第二次標記。第二次做的標記應與第壹次做的標記區分開來。
3.待瓜類完全成熟後，從第二次標記的植株中選擇生長在健康、無病或輕病植株上的瓜類，所選瓜類應大小適宜、瓜型和老瓜皮顏色符合該品種原有特征。把合格的瓜分開挑，留作籽瓜，堆起來催熟10-20天，然後切瓜，取出籽漿，擠壓。
4.有條件的話，還可以分別采集每個瓜的種子，分別品嘗每個瓜，保留口感好的瓜采集的種子，剔除口感差的瓜采集的種子。