5歲以下兒童免票，5-10歲兒童購半票（HKD95/HKD115），10歲以上購成人票。
廣九直通車乘客可隨身攜帶免費行李：大人20公斤，兒童10公斤（包括免費兒童），每件攜帶品的長寬高相加之和不得超過160厘米，超重應辦理托運。
廣九直通車分了兩種車：KTT—香港車雙層；普通車—國內車單層。
廣九直通車乘客請於開車前45分鐘到站辦理出境手續，登車閘門將於開車前10分鐘關閉。
廣九直通車退票須知：
提前三天11:00前辦理退票手續，退票費為直通車票價的30%；
提前兩小時辦理退票手續，退票費為直通車票價的50%；
開車前兩小時之內的廣九直通車票則不接受退票；香港所購的九廣直通車票不得更改或退票，只能在香港辦理。
為了配合全國鐵路調整，廣九直通車時間2012年12月21日起作了新的調整，廣九直通車班次如下：