但長時間冷凍或冷藏會影響海蜇的口感。冷凍海蜇解凍後會嚴重脫水，失重率超過50%，因此失去脆性，口感大打折扣。所以盡量不要把水母放在冰櫃裏。可以把海蜇身上的水擦幹，用保鮮膜或者塑料袋密封，然後放入冷凍室。
這樣可以很大程度上保持海蜇的新鮮度，密封的環境可以防止細菌汙染，減少水分流失，盡量保持其脆性。水母在室溫下可以保存24小時，在冰箱裏可以保存壹周。海蜇買回來後要註意盡快食用，或者拆封後存放在保溫條件好的冰箱裏，防止變質不能食用。
保存方法
新鮮的海蜇可以直接用鹽保存，但海蜇不能沾上淡水和其他汙染物。就在鹽裏來回滾，讓它的表面都是鹽。將沾上鹽的海蜇放入可密封的廣口瓶中，存放在陰涼處。
或者直接用清水將海蜇清洗幹凈，然後用保鮮膜包好，放入冰箱冷藏。優質海蜇皮呈白色或淡黃色，有光澤，無紅斑、紅衣、泥沙。質量好的海蜇，皮薄、寬、白、韌而不脆。把海蜇嚼在嘴裏，如果能發出脆脆的“咯咯”聲，咬下去就是優質海蜇。