維生素B1焦磷酸由維生素B1和三磷酸腺苷結合而成，是碳水化合物代謝的必需輔酶。當這種輔酶缺乏時，會導致氧化代謝受阻，丙酮酸和乳酸堆積，從而影響機體的能量供應。維生素B1仍能抑制膽堿酯酶的活性。維生素B1缺乏時，膽堿酯酶活性增強，乙酰膽堿水解加快，導致神經沖動傳導障礙，影響胃腸道和心肌功能。維生素B1主要用於預防和治療維生素B1缺乏癥及其引起的腳氣病或溫尼克腦病，也可用於周圍神經炎和消化不良的輔助治療。
維生素B1對腎功能正常的人幾乎沒有毒性。過量使用維生素B1可能會引起發紺、坐立不安、消化道出血、惡心、咽喉痛、乏力等不良反應。
維生素B2在體內轉化為黃素單核苷酸和黃素腺嘌呤二核苷酸，兩者都是組織呼吸的重要輔酶，參與糖、蛋白質和脂肪的代謝，維持正常的視覺功能和促進生長，激活維生素B6將色氨酸轉化為煙酸，可能與維持紅細胞的完整性有關。臨床上主要用於預防和治療維生素B2缺乏癥，如口角炎、舌炎、口唇皸裂、滑囊炎、角膜血管化、結膜炎、脂溢性皮炎等。還可用於偏頭痛的輔助治療。
水溶性維生素B2在腎功能正常時毒性很小，但長期大劑量服用可能引起眼部不良反應，如視力模糊、眼痛、畏光、角膜混濁、進行性圓錐角膜、角膜腫脹、點狀角膜炎等。，甚至可能誘發潰瘍性角膜炎等嚴重不良反應。
維生素B6在體內通過ATP的作用轉化為具有生理活性的磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺。是某些氨基酸的轉氨酶、脫羧酶和消化酶的輔酶，參與糖、蛋白質和脂肪的正常代謝，與白細胞和血紅蛋白的產生有關。臨床上主要適用於預防和治療維生素B6缺乏癥，緩解部分患者因妊娠、抗癌藥和放療引起的惡心嘔吐，還可用於治療白細胞減少癥、鐵粒幼細胞性貧血、嘴唇幹裂等。、預防和治療因大量或長期服用異煙肼引起的末梢神經炎、焦慮、失眠、驚厥和昏迷，用煙酰胺治療糙皮病。
當腎功能正常時，維生素B6幾乎沒有毒性。如果妳每天服用200毫克超過30天，它會導致維生素B6依賴綜合癥。連續幾個月每天應用2-6g可引起嚴重和永久性的周圍神經病變，進行性步態不穩至腳麻木和手不靈活，停藥後可緩解，但仍較弱。此外，據報道，口服維生素B6可引起便秘、嗜睡、食欲不振等不良反應。據報道，高胱氨酸尿癥患者服藥後血清葉酸濃度下降。罕見的過敏反應。
葉酸是由蝶啶、對氨基苯甲酸和谷氨酸組成的水溶性B族維生素，是體內細胞生長和繁殖所必需的。葉酸在胎兒懷孕過程中起著不可替代的作用。缺乏葉酸不僅會導致胎兒畸形，尤其是神經管畸形，還會增加孕婦發生先兆子癇和胎盤早剝的風險。此外，葉酸缺乏還會影響紅細胞的分裂和成熟，導致巨幼細胞性貧血。最後，葉酸還可以參與人體內同型半胱氨酸的代謝，葉酸缺乏會導致高同型半胱氨酸血癥，顯著增加中風的風險。適用於各種原因引起的葉酸缺乏和巨幼細胞性貧血，預防胎兒先天性神經管畸形，是孕婦和哺乳期婦女的預防用藥，也可用於治療高同型半胱氨酸血癥。
葉酸可引起臉紅、氣管痙攣、紅斑、皮疹、瘙癢、焦慮等不良反應。長期用藥可引起怕食、食欲不振、惡心、腹脹等胃腸道癥狀。大量服用葉酸時，會引起尿黃。腎功能正常的患者很少發生中毒。
維生素B12是壹種紅色的含鈷化合物，在轉化為甲鈷胺和輔酶B12之前沒有活性。缺乏維生素B12會阻礙DNA合成，影響紅細胞成熟，引起巨幼細胞性貧血。維生素B12也間接參與了胸腺嘧啶脫氧核苷酸的合成。但維生素B12缺乏會導致甲基丙二酸排泄增加，脂肪酸代謝異常，這很可能是導致神經系統疾病的原因之壹。主要用於治療巨幼細胞性貧血、飲食不良或吸收不良等各種原因引起的維生素B12缺乏，也可用於多發性周圍神經炎、神經痛、神經萎縮等神經系統疾病。
維生素B12可導致低鉀血癥、高尿酸血癥、步態不穩、頭暈、焦慮、共濟失調、頭痛、感覺異常、反應遲鈍、惡心、嘔吐、腹瀉、厭食、舌炎、喉嚨痛、紅細胞增多癥、背痛、肌痛、關節炎、疲勞、呼吸困難、肺水腫和鼻炎。