法源寺中最為珍貴的寶貝，當屬大雄寶殿之後的憫忠臺。憫忠臺壹名念佛臺，又稱觀音殿。憫忠臺周圍護以磚欄，殿堂建於臺上，臺基高1米多，殿堂的外墻以12柱為架，室內再以12柱支撐，構造獨特，別致美觀。而樣式則與故宮禦花園中的萬春亭相同，後者正是仿照憫忠臺而建。
這裏保存著法源寺的歷代石刻、經幢等，以唐《無垢凈光寶塔頌》、《憫忠寺藏舍利記》、《承進為薦福禪師造陀羅尼經幢》，遼代的《燕京大憫忠寺菩薩地宮舍利函記》最為珍貴。
其中《憫忠寺重修舍利記》中有"大燕城內，地東南隅，有憫忠寺"壹句，後世正是據此才推斷出當年幽州城的規模和大致的格局。
殿外山墻，還嵌有清代著名書法家翁方鋼復制的唐"雲麾將軍碑"殘柱基，另有清乾隆皇帝抄寫的《心經》、1806年詩人余集等人分別題寫的《法源八詠》等碑刻，是研究佛學和法源寺歷史的重要資料。
憫忠臺院中還有壹具石雕香爐，雕鏤精致，刀法細膩，是不可多得的藝術珍品。
憫忠臺後面的殿堂叫凈業堂。堂前有壹巨大石缽，雙層石座，周圍雕著海水花紋和山龍、海馬及八寶等形象，雕刻極為精美，可與元代的"瀆山大玉海"媲美。
凈業堂內供奉著總高5.65米的明代銅質五方佛像，極為罕見。造像實高4.58米，其上層為安坐在須彌座上的毗盧佛；中層為東西南北四方佛；下層為千瓣蓮花寶座，每瓣上雕壹小佛，形成"千佛繞毗盧"的景象，表示佛之諸多化身都圍繞依附佛的法身。
銅像安置在高1.1米的石質須彌座上，座的四周鏤刻著力士以及升龍浮雲，自然古樸。這組佛像原在西四報子胡同的隆長寺內供奉，寺毀後被移至此。
該殿原本還珍藏了唐玄奘法師的頂骨舍利，玄奘法師的頭骨舍利是988年由金陵長幹大師於終南山的紫閣寺內發現的，壹起收藏於長幹寺。清鹹豐年間寺及舍利塔皆毀，後因建築施工而發現了石函，移置於法源寺供奉，但可惜不久後即被盜，此後舍利杳無音訊。
第五進院落大悲壇又稱觀音殿，面闊5間，殿後接抱廈1間。殿前對聯為乾隆皇帝撰文手書，題為"華雨靜飄空色外，心珠常印摩尼中"。
該殿供奉的都是觀音像，形態各異，***有7尊。殿正中是3尊明代的木胎幹漆制的大士像，中間為聖觀音，左為十八臂的準提觀音，右為自在觀音。在殿的左右兩側還各有兩尊，左側是送子觀音與眾寶觀音，右側是綠度母與千手千眼觀音。
就陳設觀音的數量上看，與常說的七觀音相吻合，但無論是密宗六觀音，還是天臺宗的六觀音，均與之不符，可見這些塑像可能並非壹組，而是後世組合在壹起的，既有六觀音中形象，又有三十三觀音中的形象，還有藏傳佛教的綠度母形象，構成復雜。
殿內陳列著唐代至清代的各種佛經善本，並有西夏文、回鶻文、蒙古文、藏文和傣文的佛經。在大悲壇內還陳列著清乾隆年間制作的3座琺瑯塔，高2.4米，精美細致。
這裏陳列著歷代佛像、石刻及藝術珍品，有我國最早的東漢時代的陶佛座像，有東吳時代的陶魂瓶，有北齊石造像、唐石佛像、五代鐵鑄佛像、宋木雕羅漢、元鋼鑄觀音、明木雕伏虎羅漢等，都是珍貴文物。另外還有不少各國贈送的經像文物。
最後的殿堂是藏經閣，大殿全部用青磚鋪地，閣上供奉著大士像，為木胎幹漆所制，是明代造像藝術精品。閣內珍藏著是、清時期所刻藏經。日本國寶"鑒真大師像"到我國巡展時，曾在這裏供奉了7天，有16萬信徒和群眾前來瞻仰、觀看。
藏經閣內藏有壹尊北京內城最大的臥佛像，長7.4米，是原先臥佛寺中供奉的佛像，後輾轉到此。