該文件夾的目的是減少DLL文件引起的配置問題，保證Windows的正常運行。不能刪除其中的文件。
如果強制刪除winsxs文件，電腦幾乎無法進入Windows的安全模式，即Windows無法正常運行和使用。
擴展數據:
Windows系統目錄是指存儲操作系統主要文件的目錄，目錄中的文件直接影響系統是否正常工作。
主要Windows系統目錄及其功能:
1，所有用戶文件夾:
(Win9x/ME)所有用戶文件夾，默認包括系統登錄時的桌面文件和開始菜單的內容。
(Win2000/xp)在Win2000/xp的系統目錄中沒有這個文件夾。Win2000/xp將用戶的信息放在根目錄下的Documents and Settings文件夾中，每個用戶對應壹個目錄，包括開始菜單、桌面、收藏夾、我的文檔等等。
2.應用程序數據文件夾:
(Win9x/ME)應用程序數據文件夾。包括任務欄中的快捷方式，輸入法的壹些文件等等。根據妳系統使用的軟件不同，這個目錄下的內容也不同。
(Win2000/xp)在Documents and Settings文件夾中，每個用戶對應壹個Application Data文件夾，由於使用的軟件不同，每個用戶的目錄內容都是壹樣的。
3.Applog文件夾:
(Win9x/ME)應用程序邏輯文件目錄。邏輯文件是用於記錄信息的文件，例如應用軟件運行時要調用的文件和要使用的地址。要查看這些文件，只需用記事本打開它們。
4.Catroot文件夾:
(Win9x)計算機啟動測試信息的目錄。目錄中包含的文件大多是關於計算機啟動時檢測到的硬件和軟件信息。
(WinME)此文件夾位於系統目錄的系統目錄中。
(Win2000/xp)該文件夾位於系統目錄的system32目錄中。
5.命令文件夾:
(Win9x/ME)DOS命令目錄。包括DOS下的很多外部命令，雖然都是小工具，但是真的很有用，尤其是系統崩潰的時候。
(Win2000/xp)這些DOS命令位於系統目錄的system32目錄中。
6.配置文件夾:
(Win9x/ME/2000/xp)配置文件夾，裏面有壹些MIDI樂器的定義文件。
7.桌面文件夾:
(Win9x/ME)桌面文件夾。在桌面上包括壹些圖標。
(Win2000/xp)這個文件夾也存在於系統目錄中，在Documents和Settings文件夾的每個用戶目錄中也有壹個“Desktop”文件夾。
8.下載的程序文件文件夾:
(Win9x/ME/2000/xp)下載文件夾。此文件夾包含顯示打開的網頁所需的文件，其中大部分用於運行網頁上的動畫。
參考資料:
百度百科-Windows系統目錄