刺耳的警報聲突然響起，通過收音機傳到每個人的耳朵裏。第八殖民地“白雪公主”正遭到突然襲擊，防禦力量正被迅速瓦解。與此同時，幾個帶著帽子的僧侶突然出現在白雪公主裏面，開始追捕研究人員...當入侵的機器人闖入白雪公主時，裏面已經血流成河了。那些修士留下壹句“妳太遲了，復仇者，妳做的還不夠”就神秘消失了。
接到求救電話的聯合宇宙軍戰艦很快趕到，但白雪公主的爆炸早已在各處打響。入侵機器人留下的唯壹痕跡是玻色子跳躍前的模糊影響，這應該是比它大幾十倍的大型戰艦所為，於是幽靈機器人的故事不脛而走。
因為四個殖民地連續發生爆炸，地球整合軍成立事故調查委員會調查事件，但他們不相信機器人玻色子跳躍，排除宇宙軍。為此，聯合太空軍展開了自己的調查，計劃從玻色子跳躍系統入手，其中就涉及到葫蘆計劃。葫蘆計劃是在人類活動頻繁的宇宙中的壹些殖民地之間建立玻色子跳躍通道，讓擁有可以承受跳躍沖擊的維度扭曲壁的戰艦可以很容易地在郁金香中穿行。按照計劃，以星野琉璃少校為艦長的機動戰艦NADESICO B奉命出發前往葫蘆計劃的中心——殖民地“天空照”。
在殖民地“趙天”號上，劉力被當地指揮官故意冷落，於是她將計就計，表面上接受殖民地安排的所謂“視察”，暗地裏使用納德西科B號中的超級計算機“思考並”入侵“趙天”號的計算機系統。結果她不僅發現了葫蘆計劃官方設計中沒有的玻色子跳躍通道，還發現了大量玻色子跳躍的非正式人體實驗記錄。
恰在此時，“趙天”號的電腦系統出現異常，電子屏幕上寫滿了奧蒂卡字樣，無法正常工作。“奧蒂卡反過來就是AKITO，也就是明人。”突然想到這的玻璃似乎預感到了什麽。“那是暗號還是巧合？但是那個人...明和尤利加都死了。”
入侵者終於出現了，在玻色子的強光下。就連納德西科都認不出來的入侵機器人也只有十幾米長，但卻很刺激，很強大。此時，劉力果斷下令納德西科進入戰備狀態但不參加“趙天”號的防禦戰，而是靜觀其變。另壹方面，據《天空》報道，梁紫率領著艾特巴利斯團隊。入侵者似乎無法抵抗挑戰，想要撤退，但這是壹種轉移。當巴瑞斯團隊被引到殖民地的外圈時，壹艘不知名的戰艦突然通過時空跳躍出現，殖民地守衛被重力波炮攻擊嚴重損壞，入侵的機器人也趁著混亂進入了殖民地。
“妳所認識的天河明人已經死了，我要妳接受他曾經活過的證據。”被稱為“電子惡魔”的女孩星野琉璃是劉力+超級計算機萬斯+納德西科C =無敵的納德西科B的隊長。
最終決鬥在即，明人騎的黑色機器人蓄勢待發。
他會回來的，如果他不回來，我們會追上去，因為那個人對我們很重要。"
這時，在殖民總部，壹群自稱是火星繼承者的人發動政變，占領了“天體照”。另壹方面，跟隨入侵機器人進入基地的梁紫看到了上壹次戰爭中地球和木星都想要的火星遺跡——玻色子跳躍的黑匣子。黑暗中突然傳來令人窒息的鈴聲，“危險！”聽到黑色機器人司機的警告，梁紫僥幸躲過了偷襲。球鞋出現了，他們是上次《白雪公主》裏殺人的和尚，也是火星-無情刺客後繼者背後的影子。和尚的首領對黑機器人說:“妳是不是要死在妳老婆面前？”隨著這個聲音，廢墟慢慢展開，原來裏面出現的是利加。事實證明，西甲並沒有死，梁紫想。明朝人呢？為什麽剛才那個黑人機器人司機的聲音那麽熟悉？啊！明人，他們還活著！
在混戰中，梁紫被前來支援他的紅月所救。明和余的下落不明。“天體照”最終被火星的繼承者們炸開了鍋，他們隨後占領了火星的極冠，在那裏和支持者們聚集在壹起，想要依靠遺跡的力量對抗統壹軍。通過調查，我們知道火星的繼承者們已經與內魯加道的競爭對手聯手，希望通過掌握玻色子跳躍通道的“葫蘆計劃”來實現自己的野心。正因如此，我們需要幾個A級跳躍手來做玻色子單體跳躍的飛行員。明和余在蜜月旅行中被火星繼承者們綁架，當局聲稱他們是為了保密而被殺害的。後來明人僥幸逃脫，壹直在暗中對抗火星的繼承者。
面對新的威脅，劉力等人奉命返回地球聚眾，已退役的前納德西科成員再次聚集，許多年輕人也加入其中。然而，他們並不是唯壹到達地球的人...戰鬥即將爆發。結局是什麽？