水晶性脆，註意防重壓、防摔、防高溫，防強堿、強酸。移動水晶時，最好戴上柔軟的棉質手套，避免手上的油漬汙染收藏品。提起水晶物品時，不要抓著水晶擺件的頂部或外延部位，應抓緊水晶的底座或整個身體。發現水晶藏品上有灰塵，切勿使用羽毛刷子，而要以輕軟而不含絨毛的布料輕拂除塵，不要用力拂拭，以免磨破水晶。
水晶酒杯要保持晶瑩剔透，就要經常清洗。清洗時，不要把它們突然浸泡在高溫或低溫的水中。不要把洗好的平底水晶杯疊在壹起，以避免受壓而破裂。水洗水晶酒杯時，既不能用機器洗，也不能用清潔布擦洗，手清洗是最好的方法。註意不要抓住酒杯的腳柄去甩幹或清洗，因為柄柱容易在用力地情況下造成斷裂。
用久了的水晶插花瓶，內壁總是會附上壹層難看水垢，影響水晶器皿的美觀。這時候若用微酸性的醋水混合液進行清洗就能有效地去除水垢。因此在清潔水晶時，可將它放在鹽水中（海鹽、精鹽）浸泡24小時，然後用清水洗凈，用幹凈棉布擦幹即可；也可將水晶放在海水中浸泡40分鐘即可；若體積較小者亦可放在紫晶洞裏面，亦可達到凈化、消磁等功能。如果要清除水晶燭臺的遺蠟，可用溫水浸泡3分鐘，切忌使用熱水。然後用牙簽小心清除遺蠟，再以溫水沖洗，最後用壹塊輕軟而不含絨毛的布擦拭。
有油漬或手印留在水晶器皿上時，可以用微溫的肥皂水洗滌，再用清水沖幹凈。要避免重復在熱水或清潔濟中清洗。有切割的水晶擺件，切割的部分可用牙刷輕輕清洗，如果有不易洗掉的汙點，可以把檸檬切開抹些鹽，輕輕擦洗。也可用幾滴加鹽的醋來擦。
在儲放水晶杯時，事先在擱架上鋪上墊布，並將每壹只水晶杯以底朝天的方式壹壹放好。把水晶藏品放在密封的玻璃櫃或陳列箱內，以減少水晶表面積聚塵埃的機會，也可減少人手接觸，避免造成破壞。不要讓收藏品靠得太近，否則碰到其中壹件時，其他也會因骨牌效應而傾倒。確保飾櫃穩固可靠，不易動搖。把水晶放在鏡子旁，讓光線折射到水晶表面，避免把水晶放在掛畫的或其他物品下方，比如晃動的窗簾容易把水晶擺件撞倒而摔壞。
如果要長時間存放水晶藏品，不要使用發泡膠紙或塑料袋。這類包裝袋會增加溫度，對水晶造成損害。同時，千萬不要把水晶存放在閣樓或地窖，以免它們置身於惡劣的環境中。對於紫晶首飾，要盡量避免強光照射，否則，會影響它的色彩靚麗。