《古生物化石保護條例實施辦法》規定，申請發掘古生物化石的單位應當提交下列材料:
(1)化石發掘申請表。
(二)申請發掘古生物化石單位的證明材料，包括:①單位證明材料和法定代表人身份證明；(二)3名以上技術人員的古生物或相關專業技術職稱證明，3年以上古生物化石發掘經歷證明；發掘活動的領隊除提供3年以上古生物化石發掘經歷的證明外，還應提供古生物高級職稱證書；(三)滿足古生物化石發掘需要的設施設備證明材料；(四)古生物化石修復技術和保護技術的證明材料；(五)符合古生物化石安全保存設施、設備和場所要求的證明材料。
(3)古生物化石發掘計劃，包括發掘時間和地點、發掘對象、發掘現場地形地貌、區域地質條件、發掘面積、層位和工作量、發掘技術路線、發掘負責人和參與人員等。
(四)化石標本的保存方案，包括發掘出的化石標本可能的屬、種，化石標本的保存地點和條件，收藏單位為防止化石標本風化損壞所采取的措施。
(五)古生物化石發掘區自然生態條件恢復方案，包括發掘區自然生態條件現狀、發掘後自然生態條件恢復措施、自然生態條件恢復工程量、生態條件恢復項目資金概算及其籌措和實施情況。
(六)法律法規規定的其他材料。
《古生物化石保護條例》第12條明確規定，國土資源部應當自受理申請之日起3個工作日內將申請材料寄送全國古生物化石專家委員會。國家古生物化石專家委員會應當自收到申請材料之日起10個工作日內出具書面審查意見。評估意見應當作為是否批準發掘古生物化石的重要依據。國土資源部應當自受理申請之日起30個工作日內完成審查，對符合規定條件的申請人，以及古生物化石發掘方案、發掘標本保存方案和發掘區域自然生態條件恢復方案是否可行的，予以批準；對不符合條件的，書面通知申請人並說明理由(圖6-1)。國土資源部在批準古生物化石發掘申請前，應當征求古生物化石所在地省、自治區、直轄市人民政府國土資源主管部門的意見；批準後，應當通知所在地省級國土資源主管部門。
圖6-1化石發掘申請和審批流程
國土資源部應當自受理發掘申請之日起5個工作日內，向古生物化石所在地的省、自治區、直轄市人民政府國土資源主管部門發送征求意見函。省、自治區、直轄市人民政府國土資源主管部門應當聽取化石所在地的市、縣級國土資源主管部門的意見，並在10個工作日內回復意見。