如果培養微生物(如真菌)，液體培養基比固體培養基有以下優點:
1.低成本高效率
2.有利於純培養，純度高，培養有活力，生長速度快。
3.減少汙染，因為接種物生長速度快，所以其生長速度超過雜菌生長速度，保證質量。
4.菌絲體生長快，萌發點多，萌發點多。
以上四點主要針對培養真菌！因此，液體發酵培養是微生物培養的必然趨勢。
如果培養植物，液體培養基與固體培養基相比具有以下優點:
1.低成本
2.根懸浮在液體營養液中，保持動態培養狀態，更有利於根吸收氧氣，從而比固體培養更有利於植物的生長。
3.生長量和速度都比固體培養的多且快。
4.有利於植物根系的發育