2021 1 25、淩晨發生火災，消防人員及時趕到將火撲滅，但火勢太大，經過多個小時的撲救終於控制住。大火過後，李文學院原有的大部分建築已被燒毀，藏在學院內的文物和珍貴古籍也受到不同程度的損壞。火災發生後，引起了社會各界的關註和慰問，許多人向書院捐款，希望盡快修復書院。政府也迅速行動，組織專業力量對書院進行安全評估和修復，同時加強文物保護和消防管理等措施。
目前，李文學院正在進行修復工作，以恢復其原有的歷史風貌。