1.生物除磷是通過活性汙泥產生揮發性有機酸作為聚磷菌生長的營養物質，促進活性汙泥的生長和繁殖。該方法還可以將難以進行物理和化學處理的有機磷和偏磷酸鹽轉化為可以進行化學處理的正磷酸鹽。但這種方法會使磷殘留在生物體內，環境變化後微生物很可能再次被釋放出來。
2.化學除磷劑除磷法可以快速處理汙水中的正磷酸鹽，適應性強，但會相對降低汙泥濃度，增加水中汙泥量，導致金屬物質的影響，產生顏色。