有兩種基本類型的疫苗:減毒活疫苗和滅活疫苗。活疫苗和滅活疫苗的特點不同，決定了疫苗的使用方式。
5.1減毒活疫苗
減毒活疫苗是在實驗室中通過改良(“野生”)病毒或細菌制備的。獲得的疫苗菌株的微生物保留了復制(生長)和免疫的能力，但它們通常不是病原性的。減毒活疫苗包括活病毒疫苗和活細菌疫苗。
6.2滅活疫苗
滅活疫苗可以由完整的病毒或細菌或其裂解片段組成。裂解疫苗可以是蛋白質疫苗或多糖疫苗。蛋白疫苗包括類毒素(滅活細菌毒素)和亞單位或亞毒性顆粒產品。大多數多糖疫苗由來自細菌的純化細胞壁多糖組成。結合多糖疫苗是將多糖與蛋白質化學連接得到的疫苗，使多糖成為更有效的疫苗。