1.中醫現代化成就不明顯。我國多使用中藥，但由於儀器和技術的限制，中藥的提取、分離、精制等現代加工技術落後於日本、韓國等國家。
2.許多中藥不符合國際檢驗標準。如重金屬、農藥殘留超標等。
3.中藥品種混亂。品種鑒定工作不到位。
4.缺乏統壹有效的管理手段，管理力度不夠。
5.科技的發展是有限的。使得原理分析困難，不容易被接受。