底濾的優點:底濾為濾料提供的空間最大，所以處理能力最強(註意不是效率)！有利於硝化細菌的培養。壹般來說，底部過濾網有3或4格，過濾材料的順序是:第壹格，白棉，藤棉，第二格；細菌房、陶瓷環、玻璃環、過濾球等。(可以選壹個或者壹起用)；第三格，如果是最後壹格，可以放泵和加熱棒，如果不是，也可以放菌室或麥飯石；但是最後，妳需要給泵和加熱棒留壹個空間。
底濾的缺點:體積巨大壹般會占用魚缸底櫃的空間，對水泵的要求比較高，耗電量比較大。水泵壹定要配好溢流，否則水會積滿金山或者水泵幹涸。所以技術水平略高。