東巴畫的繪畫手法因時，因地、因人而異，形成多種風格，但從總體上大致可為兩類：
（壹）保留原始古樸畫法的；如東巴畫譜，木牌畫和經書繪畫類等，此類畫多用竹筆和自然顏料繪制，單線平塗；造型質樸古拙，簡練概括，變形誇張，線條粗獷流暢，率真豪放，剛柔兼備，有古樸稚拙之美。
（二）吸收融合漢、藏民族畫法的；如有些卷軸畫、神路圖和壹些畫法精細的紙牌畫。此類畫多用毛筆和礦物質顏料繪制，把東巴畫傳統的古拙畫風與外來的精細清麗畫風有機地融匯在壹起，形成粗細有致，疏密相間的風格，構圖日趨嚴謹，畫面繁實，層次分明，設色富麗，線條工整，造型準確，技術技巧有了突破性發展。