1.過分關註短期財務結果可能會鼓勵公司管理層的短期行為，而忽視公司的長期價值創造。
2.財務指標反映企業過去的經營業績，衡量工業時代的企業能否達到要求。然而，在當前的信息時代，客戶、供應商、員工、技術創新等因素對企業經營績效的影響越來越大，杜邦分析在這些方面是無能為力的。
3.在當前的市場環境下，企業的無形知識資產對提高企業的長期競爭力非常重要，但杜邦分析法無法解決無形資產的估值問題。