壹般固體菌種生產過程由試管母種擴大到二級種和三級種，生產周期長，汙染率高，成本高，需要大量的人力和空間，管理難度大。很難滿足大規模生產的需要。
壹般工藝流程如下:母種→母種繁殖(培養基配制→接種→培養檢驗→成品)↓
↓ ←成品原種←(培養檢驗←冷卻接種←滅菌←配料包裝)原種生產。
栽培種子生產(配料包裝→滅菌→冷卻接種→培養檢驗)→成品栽培種子。
液體菌種生產具有純度高、活力強、繁殖快等特點。接種到培養料中具有流動性好、萌發點多、細菌生長快等特點。可以大規模生產。
液體菌種生產過程
工藝流程圖:
空氣壓縮→過濾
↓
配料→裝罐→殺菌→冷卻→接種→培養→液體種子。
↑
試管斜面種子→三角瓶液體專用母種