該策略的具體步驟包括三個方面:壹是利用計算化學模擬目標蛋白質的結構，預測藥物與蛋白質的相互作用模式；二是設計具有特定化學結構的藥物分子，並根據計算出的相互作用模式對藥物分子進行優化；三是通過實驗驗證藥物的活性和選擇性。
基於結構的藥物設計有很多優點，其中最顯著的是可以快速設計出高活性、高選擇性的藥物分子，同時降低實驗成本和時間。此外，基於結構的藥物設計還可以幫助研究人員更好地理解藥物與蛋白質分子的相互作用機制。
總之，基於結構的藥物設計是壹種非常重要的藥物研發策略，可以快速設計出具有特定活性和選擇性的藥物分子，為新藥研發提供有力支持。