有各種處理糞便的方法，包括物理方法，
化學法、微生物發酵法和綜合法在各方面與外來法、本土法、古今法並存，各有利弊，應因地制宜。傳統的糞肥發酵作肥料的方法是讓其自然堆積發酵5~6個月，用作飼料大約需要20天或壹個月，這樣散發出臭味，不僅汙染環境，而且造成營養物質大量流失。利用微生物發酵處理糞便，不僅可以加快發酵進程，縮短發酵時間，防止浪費，提高糞便的營養價值；而且可以利用發酵產生溫度來烘幹糞便，節省能耗，成本低廉，操作簡單，易於推廣，受到用戶的歡迎。該方法適用於處理動物糞便，如雞糞、豬糞、牛糞、鴨糞、鵪鶉糞、兔糞、鴿糞等。。