數字PCR是在模板DNA、引物(模板片段兩端的已知序列)和四種脫氧核苷酸的存在下，依賴於DNA聚合酶的酶促合成反應。擴增的特異性取決於引物和模板DNA的特定組合。與QCPR相比，BIOG digital qPCR可以直接統計DNA分子的數量，是對初始樣本的絕對量化。
擴展數據:
3D數字PCR基於納米流體芯片進行檢測。通過壹次檢測，將樣本分成上千個單獨的PCR，檢測結果有的是陽性有的是陰性，然後不需要校準就可以統計出分子的絕對數量。目前可以檢測到2萬個0.8nL的液滴(樣本)，可以對靶位進行精確定量的研究。