肥皂的分子結構可以分為兩部分。壹端是帶電的極性首席運營官-(親水性位點)
另壹端是非極性碳鏈(親脂性位點)。肥皂能破壞水的表面張力。當肥皂分子進入水中時，具有極性的親水部分會破壞水分子之間的吸引力，降低水的表面張力，使水分子幾乎均勻地分布在待清潔的衣物或皮膚表面。
肥皂的親油部分深入油漬，親水部分溶於水。攪拌後，這種結合形成更小的油滴，其表面覆蓋著肥皂的親水部分，不會重新結合形成大的油漬。如果這個過程(也叫乳化)重復多次，所有的油漬都會變成非常微小的油滴溶解在水中，很容易被洗掉。
擴展數據:
肥皂的發展；
肥皂是宋代出現的壹種合成洗滌劑，是將天然皂莢(又名皂莢、掛刀、皂莢，俗稱皂莢)搗碎研磨，加入香料等物，制成桔黃色大小的圓球，用於洗臉、沐浴身體，俗稱“皂球”。
宋人細心的《武林舊事》(卷六)《小掮客》記載，南宋京都臨安曾有壹個專做“皂團”的商人。
明代李時珍的《本草綱目》中記載了“皂莢”的制作方法:皂莢生於高山，樹高，葉似檀香皂莢，五六月開花，莢厚三四寸，肉質，內有數個斑點，大如手指，不圓，內有白仁，可食用。
十月摘莢，煮爛搗爛，白面香丸，沐浴身體，去垢潤澤，勝於皂莢。除了天然皂莢，無患子等植物也在民間流傳，成為很好的清潔劑。
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