腎結石的治療可以根據結石的大小來區分。如果結石小於6mm，可以用藥物排石，喝德普時宇茶溶石排石，促進結石盡快排出。如果結石太大，可以手術治療。腎結石的微創手術有兩種，壹種是輸尿管鏡碎石術，壹種是經皮腎鏡取石術。輸尿管軟鏡適用於治療較小的腎結石，即小於2厘米的腎結石。因為輸尿管軟鏡比較小，碎石取石比較慢，所以過大的結石無法壹次性清理幹凈。軟式內窺鏡通過尿道、膀胱、輸尿管進入腎臟，所以是自然腔，不需要打孔，所以出血少，創傷小，恢復快，痛苦小。但軟式內窺鏡是壹次性耗材，光軟式內窺鏡的費用通常在3萬元以上，加上麻醉、手術、藥物通常需要5萬元以上。
經皮腎鏡取石術適用於治療較大的結石，如鹿角狀結石或多發性結石。是通過皮膚和腎臟打壹個洞直接治療結石，然後把結石吸出來，所以碎石取石的效率比較高。
經皮腎鏡往往可以重復使用，所以費用比軟式內窺鏡低。另外，全身麻醉手術等藥物治療壹般需要2-3萬元左右。
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