腎結石的治療主要是解痙鎮痛，必要時需要手術。
藥物
常見藥物:消旋山莨菪堿、坦洛新、碳酸氫鈉、曲馬多、哌替啶。
消旋山莨菪堿:屬於M型膽堿能受體阻滯劑，能松弛輸尿管平滑肌，解除痙攣。
坦洛新:屬於α受體阻滯劑，對解除輸尿管平滑肌痙攣、治療腎絞痛有壹定作用。
碳酸氫鈉:能堿化尿液，加速尿液排泄。
阿片類鎮痛藥:阿片受體激動劑具有很強的鎮痛和鎮靜作用。常用的藥物有哌替啶和曲馬多，多采用肌肉註射治療。
外科療法
當藥物不能緩解疼痛或結石直徑較大時，應考慮手術治療措施，包括體外沖擊波碎石術、輸尿管鏡碎石術(包括硬性和軟性輸尿管鏡)、經皮腎鏡取石術和腹腔鏡取石術。
體外沖擊波碎石術:沖擊波源不斷向結石發射，使結石逐漸破碎成細沙，然後隨尿液排出體外。
輸尿管鏡碎石術:包括硬性和軟性內窺鏡，經尿道置入輸尿管鏡，用套索或鑷子取出結石。如果結石較大，可采用激光或超聲波進行碎石，然後取出結石。
經皮腎鏡取石術:將腎鏡從外側置入腎盂、腎盞內進行碎石，然後取出，適用於復雜結石。