(1)原生結核是指在沈積過程中，某些礦物或化學成分在其他物質周圍聚集形成的結核。比如石灰巖中含有燧石結核，砂巖中含有鐵結核，此外還有黃鐵礦、菱鐵礦、磷灰石等結核，現代海底還有大量的鐵錳結核。這種結節壹般不穿過層理。
(2)後生結核是指巖石形成後，含礦物的溶液從層中淋濾滲入，在某些中心周圍沈澱，或與巖石中的某些物質交代而形成的結核。其特征是結核穿過層理。黃土中的石灰結核屬於後生結核。
由於風化作用，可形成結核狀團塊，稱為假結核。比如有的巖石被縱橫向的裂隙分割成許多幾何小塊，然後含有氫氧化鐵的溶液沿著裂隙滲透，溶解巖石，最後分割的巖石小塊變成褐鐵礦包圍的偽結核。