藥學專業
藥學是國家重點學科，研究方向包括現代藥物研究、新藥研發、藥物合成與分析等。同時也是全國首批博士學位授權單位之壹。此外，該校的中醫學專業也是全國領先的專業之壹，已成為我國中醫藥研究和產業的重要支柱。
制藥工程專業
學校還開設了制藥工程專業，這是國內其他高校很少開設的。其主要研究方向包括藥品生產技術和藥品質量控制。
(在比賽或辯論中)名列前茅
從專業排名來看，中國藥科大學的藥學專業壹直處於國內前列。根據教育部公布的2019年學科評估結果，中國藥科大學藥學專業排名第二。同時，學校的中醫專業在國內也是名列前茅，近年來也逐漸獲得了更多的國際認可。值得壹提的是，在制藥工程方面，學校也獲得了很多關註和好評。