不同藥材的加工方法差別很大，有的很簡單，只要曬幹、陰幹或曬幹即可，比如大部分全草、種子果。有的很復雜，比如大部分根和根莖，有的還需要水洗、去皮、整形、蒸煮、浸泡漂白、硫磺熏蒸等工序才能烘幹。比如附子(祛風除濕，治虛脫，腎虛水腫等。)毒性較大，需采取鹽水浸泡、高溫蒸煮等措施降低毒性。每道工序都要控制適度，否則會造成不必要的損失和浪費，甚至影響產品質量。
藥材在暴曬過程中，要經常翻動，防止雨淋，有的要在曬到五六成幹時，短時間堆起來，使內部水分擴散，使藥材變軟，俗稱“發汗”，再曬幹。
有些含揮發油的藥材，如薄荷、紫蘇等，不宜暴曬，應陰幹，或先曬幹至七八成，再放在遮蔭棚中陰幹，以減少揮發油的損失。
人工加熱幹燥時，如炕曬或烘幹，除了要註意藥材的厚薄外，還要嚴格控制火力，壹般先掌握火候，後掌握小火，以免炕燒或燒藥材，或發生火災。過去在湖北、四川黃連產區，因為火力控制不好，黃連被燒，火災時有發生。所以壹定要嚴格遵守操作規程，避免不必要的損失。