“清單審批匯總申報”新模式，允許電子商務企業以“清單”形式申報，海關審核“清單”，辦理實物放行手續，解決了零售出口訂單數量少、批量大的問題，提高了企業通關效率，降低了企業通關成本。通關系統會定期匯總清單形成報關單進行申報，並為企業開具報關單退稅聯，為企業解決了退稅問題，也將跨境貿易電子商務業務納入海關貿易統計。
跨境電子商務零售商品出口後，跨境電子商務企業或其代理人應在每月15前，按照同壹發貨人、同壹運輸方式、同壹生產銷售單位、同壹到達國、同壹出境海關、同壹最終目的國，提交上月通關的《中華人民共和國和中國海關跨境電子商務零售進出口商品報關單》
但允許以“列表、匯總、計數”方式辦理報關手續的，不再匯總形成《中華人民共和國出口貨物報關單》。
根據2016發布的《關於跨境電子商務零售進口稅收政策的通知》，跨境電子商務進口商品征收關稅、進口環節增值稅和消費稅，個人購買跨境電子商務進口商品為納稅人，實際成交價格為完稅價格。跨境電子商務進口稅收政策適用於從《跨境電子商務零售進口清單》範圍內的其他國家或地區進口的貨物。跨境電商進口的貨物自海關放行之日起30日內退運的，可以申請退稅，並相應調整個人年度交易總額。
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