1、掃描方式不同
ct：利用精確準直的X線束、γ射線、超聲波等，與靈敏度極高的探測器壹同圍繞人體的某壹部位作壹個接壹個的斷面掃描。
x射線：電子的韌制輻射，用高能電子轟擊金屬，電子在打進金屬的過程中急劇減速，按照電磁學，有加速的帶電粒子會輻射電磁波，如果電子能量很大，比如上萬電子伏，就可以產生x射線，這是目前實驗室和工廠，醫院等地方用的產生x射線的方法。
2、危害不同：
CT：如果受到長時間、大劑量照射，可能導致白內障、絕育、生長發育遲緩，甚至誘發惡性腫瘤或白血病。
X射線：長期接受X線會對人體造成很多傷害，如：自主神經功能紊亂、造血功能低下、晶狀體渾濁，精子生成障礙，甚至誘發腫瘤等。X線損傷是醫護人員 最常見的放射損傷。遭受損傷的細胞、組織、器官還可以引起機體繼發性損傷。
3、用途不同：
CT：CT診斷由於它的特殊診斷價值，已廣泛應用於臨床；現代工業的發展，使得CT在無損檢測和逆向工程中發揮重大的作用；航空運輸、運輸港灣，大型貨物集裝箱案件裝置。
X射線：X射線可激發熒光 、使氣體電離、使感光乳膠感光，故X射線可用電離計、閃爍計數器和感光乳膠片等檢測研究領域，晶體的點陣結構對X射線可產生顯著的衍射作用。
參考資料:百度百科-CT
參考資料:百度百科-X射線