此外，它在人類醫學中用於識別個體、確定親緣關系、醫學診斷和尋找與疾病相關的遺傳標記；可用於動物進化中動物種群的起源和進化；在物種分類中，可以用來區分不同的物種，也有區分同壹物種不同品系的潛力。它還廣泛應用於作物基因定位和育種。DNA指紋技術可以在DNA分子水平上給每個玉米品種壹個“身份證號”，因其準確、可靠、簡單、快速、易於自動化等優點，越來越多地應用於品種管理。
玉米DNA指紋就是從DNA分子的層面給每壹個玉米品種壹個能準確表明其身份的代碼，就像每個人都有身份證壹樣，DNA指紋就是玉米的“分子身份證”。
玉米的‘分子身份證’就是利用DNA指紋技術，深入到基因層面，用每個品種的特殊基因片段進行標記。
在玉米研究中心的實驗室裏，科研人員從各種玉米種子中取樣，提取DNA，擴增關鍵基因片段，放入先進的DNA分析儀進行檢測，自動將信息發送到玉米DNA指紋數據庫進行比對。如果該品種是數據庫中已有的品種，系統會自動上報。這就好比把玉米品種的關鍵遺傳標記編碼成二維碼，妳用‘掃描’就能驗證身份。