埃及大部分地區是海拔100-700米的低高原，紅海沿岸和西奈半島有丘陵和山脈。沙漠和半沙漠占全國的95%。西部的利比亞沙漠，占國土面積的三分之二，多為流沙，中間有哈裏吉、錫瓦等綠洲；東阿拉伯沙漠，石質沙漠和裸露的巖石丘。
尼羅河是世界上最長的河流，從南到北貫穿全境，在埃及境內長1.350公裏，形成兩側寬約3-1.6公裏的狹窄河谷，在首都開羅以北形成24000平方公裏的三角洲。在尼羅河的影響下，在河流兩岸的山谷中形成了面積為654.38+0.6萬平方公裏的綠洲帶。
主要湖泊有大苦湖和廷薩湖，以及阿斯旺高壩形成的非洲最大人工湖納賽爾水庫(5000平方公裏)。
該國幹旱多雨，氣候幹熱。埃及南部屬熱帶沙漠氣候，夏季氣溫高，晝夜溫差大。尼羅河三角洲和北部沿海地區為亞熱帶地中海氣候，氣候相對溫和，其他大部分地區為熱帶沙漠氣候。白尼羅河發源於南半球的熱帶草原氣候區，藍尼羅河發源於北半球的熱帶草原氣候區。兩條河的汛期不同。65438+10月平均氣溫12℃，7月26℃；全境幹旱多雨，年平均降水量50-200毫米。其余大部分地區為熱帶沙漠氣候，炎熱幹燥，溫度可達40℃[1]？。每年4月至5月常有“五旬節風”，帶著沙子損害莊稼。