在農業生產中，農藥、化肥等化學物質是導致土壤酸化、鹽漬化和微生物失衡的關鍵因素，而農藥和化肥的施用是壹項高投入高產出的作業。如果肥料技術使用不合理，肥料的有效利用率低，不僅會造成肥料的浪費，還會極大地影響農作物的生長發育。為了解決這壹問題，我國許多大中型水稻生產企業在生產過程中大量使用化學合成肥料。但由於這種肥料成本高，不僅用量大而且不環保，嚴重影響水稻生產的正常進行。
控制和治理農田環境汙染應該怎麽做？減少再利用？在確保農業生產穩定的前提下，清理和控制農田中的有機汙染物；在提高有機肥利用率的基礎上，改變有機肥養分分配方式，實現高效環保施用。比如有機肥養分的有機分解釋放，可以減少農藥的使用量，避免農藥的二次汙染。農田汙染物的清理和控制也是目前農田汙染控制的重點，可通過化學、物理或生物方法進行。
比如可以用生化的方法提高農藥的利用率。同時，通過物理方法可以大大減少農田汙染物的排放。從以上分析可以看出，農藥防治和農田環境汙染治理是相輔相成的，兩方面都要加強。