壹、雜交水稻和普通水稻的區別在於人工幹預後的區別:
進入20世紀50年代後，人類對人工幹預植物生長的認識越來越成熟。那時，人們意識到基因的改變可以使植物更適應環境，同時，植物可以結出更多的果實。因此，雜交水稻開始逐漸出現，並逐漸被世界各地區接受。普通大米是自然的產物。根據考古學家的發現，水稻最早出現在中國，距今已有7000多年的歷史。而且，考古學家發現了當時的大米。科學家發現古代的普通水稻和現代的普通水稻基本沒有大的區別，但是經過精心的人工培育，現在的普通水稻的米粒要大壹些，但是需要指出的是，區別是極其細微的。雜交水稻和普通水稻完全不同。由於人類對水稻基因的幹擾，雜交水稻的產量完全超過普通水稻。
第二，雜交水稻和普通水稻在育種上有很大的區別:
雜交水稻在育種上與普通水稻有很大不同。雜交水稻是不同水稻組合產生的種子，也就是說雜交水稻需要壹個父本和壹個母本產生種子。這也是雜交水稻的優勢，在生產中表現出高產，而且雜交水稻具有優良的抗病性，這是普通水稻種子所不具備的。
三、雜交水稻只能人工培育種子，普通水稻會留種子:
雜交水稻的種子必須是人工制造的，不會自己留下種子。但是普通的水稻可以留下種子，同時也可以繼續茁壯成長。