京九線開通運營後，大量旅客通過阜陽火車站前往全國各地，阜陽站運輸壓力逐年增大。既有京九鐵路復線，上行經阜陽站，下行經阜陽北站繞城向東。所以阜陽站的旅客列車只能由壹條上行線完成，而阜陽站又是阜淮鐵路的始發站，相互幹擾，制約了區段的通過能力。2001 12 13富陽鐵路樞紐桃園大橋擴建工程開工。該項目的建設，將對打通京九線阜陽客運“限制港”，進壹步提高阜陽樞紐運輸能力發揮極其重要的作用。這條路線從現有的岔道開始。阜陽站南端14至650米，並修建壹座1229米長的跨阜淮鐵路、傅瑩公路桃園大橋，南接京九線慈源橋。
隨著阜陽站成為農民工五大旅遊站，春運壓力逐漸加大，阜陽樞紐需要進壹步建設。2007年，鐵道部投資近6543.8+0億元改造阜陽樞紐。阜陽站改造工程:新建中間站臺2座，旅客列車到發線4條，貨物列車到發及調車線3條，1救援列車線，南北咽喉區改造；按照原標準擴建現有12m寬的引道立交橋，新建10m寬的出口隧道1和6m寬的行李隧道1，按照原標準擴建現有6m寬的隧道。五個站臺中，除1為0.5m的低站臺外，其余均為1.25m的高站臺，新建無站臺柱雨棚，以及相關的通信、信號、電力、建築、給排水等配套工程。貨車外繞線工程:阜陽北(含)至袁寨(含)新建阜淮貨車外繞線12.488km下行、12.616km上行，阜陽北至阜陽新建京九客車聯絡線3.047km，變更阜陽北至鷹寧九貨車下行3.0 km，使用4條相關專用線。改造於2008年春運前完成，極大緩解了阜陽站春運壓力，阜陽站客運能力提升80%，阜陽樞紐實現了歷史性跨越。同時，阜陽站原有的貨運功能由改建後的潁南站承擔。
從2008年開始，阜陽樞紐建設進入了壹個新的時代。2008年8月，上海局京九鐵路電氣化工程在阜陽開工建設。福懷線富陽樞紐、富陽北至袁寨站(不含)電氣化改造工程也納入京九電氣化工程，富陽至九江線路加快建設。5438年6月+2009年2月，京九線上海局內段電力機車成功下線，阜陽樞紐進入電氣化時代。
2008年6月29日，漯河至阜陽復線鐵路電氣化改造工程開工。涉及阜陽樞紐的工程有阜陽上下遊疏解線、京九上遊連接線引入、阜陽西站至阜陽站客運通道等。由於上海和武漢鐵路局的協調，以及7月23日鐵路事故對建設資金的影響，原計劃2010年底完工的工程被大大推遲，預計2014完工。屆時，洛福鐵路將更加順暢地連接到阜陽樞紐，阜陽樞紐的客貨輻射能力將進壹步增強。
2009年8月，阜陽至六安鐵路開工。該鐵路是富陽-六安-安慶-景德鎮鐵路的重要組成部分。為單線電氣化鐵路，設計時速160km/h，預留時速200km/h復線擴能條件。涪陵至柳州鐵路引入富陽樞紐袁寨站，新建袁寨疏解線4.3公裏。經過四年多的建設，福柳鐵路於2013年6月投入運營。在商合杭鐵路建成前，福柳鐵路為富陽開行動車組提供了條件，富陽市政府正在積極與鐵路部門協商開通富陽至上海的動車組。
2010 1、阜淮鐵路、淮南鐵路(淮南至合肥段)、水邦鐵路電氣化擴能改造工程開工。2013年4月，阜淮鐵路電氣化竣工驗收。至此，除青福鐵路外，阜陽樞紐涉及的鐵路全部實現電氣化。
2013，10 6月商(秋)合(飛)杭(周)鐵路工程穿越阜陽項目建議書獲國家發改委批復，預計2015開工。商合杭鐵路建成後，富陽樞紐將進入高鐵時代。列入國家相關規劃的京九客運專線、鄭合客運專線，勾勒出阜陽高鐵樞紐的美好未來。