2014年7月學院官網顯示，學院在編職工1370人（含直屬附屬醫院），教師761人，具有研究生以上學歷529人，博士學位162人，具有高級職稱403人，其中正高156人。擁有國務院突出貢獻專家1人，享受國務院政府特殊津貼專家5人，全國老中醫藥專家學術經驗繼承指導教師13人，雲南省中醫師帶徒工作指導老師5人，省級突出貢獻專家3人，享受省人民政府特殊津貼專家3人，省名中醫、榮譽名中醫24人，省中青年學術技術帶頭人5名、後備人才4名，省優秀中青年中醫藥領軍人才2人。省級教學團隊4個，校級教學團隊4個，省級教學名師8人。
省級教學團隊（4個） ： 序號項目名稱項目負責人所屬機構年份1藥理學基礎與實驗教學團隊林青中藥學院20112中藥資源學教學團隊錢子剛中藥學院20123中醫臨床教學團隊秦國政臨床醫學院20094中西醫基礎醫學教學團隊袁嘉麗基礎醫學院2010校級教學團隊（4個） ： 序號項目名稱項目負責人所屬機構年份1中醫經典教學團隊陳文慧基礎醫學院20132中藥資源學教學團隊錢子剛中藥學院20123中醫臨床教學團隊秦國政臨床醫學院20094中西醫基礎醫學教學團隊袁嘉麗基礎醫學院2010 2014年7月學院官網顯示，學院建有國家級特色專業建設點2個、省級重點專業建設點5個、省級特色專業建設點5個。有國家級專業綜合改革試點1個、省級專業綜合改革試點3個，省級精品視頻公開課2個，省級精品課程17個，省級名師工作室7個，省級實驗教學示範中心3個，省級人才培養模式創新實驗區1個。
國家級特色專業建設點（2個）：中藥學專業、中醫學專業
省級特色專業建設點（5個）：中醫學、中藥學、制藥工程、針灸推拿學、中西醫臨床醫學
國家級專業綜合改革試點（1個）：中醫學
省級實驗教學示範中心（3個）：中醫臨床技能綜合模擬實驗教學中心、基礎醫學實驗教學示範中心、中藥學實驗教學示範中心
省級人才培養模式創新實驗區（1個）：中醫學專業
省級精品課程（17個）：
中醫基礎理論、方劑學、中醫診斷學、溫病學、免疫學基礎與病原生物學、正常人體解剖學、病理學、藥理學、中醫內科學、中醫兒科學、中醫婦科學、針灸學、腧穴學、中醫外科學、中醫傷科學、中西醫結合婦科學、急診學
省級精品視頻公開課（2個）：方劑學、中醫婦科學 2014年7月學院官網顯示，學院擁有省部級重點學科28個,其中國家中醫藥管理局重點學科17個，雲南省重點學科9個、優勢特色重點學科2個、“十二五”立項建設博士學位授權壹級學科2個。4個壹級學科碩士學位授權點。
中國家中醫藥管理局重點學科（17個）： 學科名稱 所屬二級學院 批準時間 學科名稱 所屬二級學院 批準時間 中醫老年病學臨床醫學院2012.09傣醫學民族醫藥學院2009.11中醫兒科學2012.09臨床中藥學中藥學院2009.11推拿學2012.09中醫管理學——中醫藥對外合作管理學臨床醫學院 2012.09中醫耳鼻喉科學2012.09國際教育學院中醫預防醫學2012.09中醫文化學基礎醫學院2012.09中醫痹病學2009.11思政部中醫腎病學2009.11人文管理學院彜藥學藥學院2012.09中醫心理學基礎醫學院2012.09中醫男科學2011.09中西醫結合基礎2012.09中醫人類學圖書館2012.09傣藥學民族醫藥學院2012.09省重點學科（9個）：
中西醫結合、藥學、中西醫結合基礎、民族醫學、針灸學、中醫內科學、中醫基礎理論、臨床中藥學、實用中藥學
壹級學科碩士學位授權點（4個）：
基礎醫學、食品科學與工程、漢語國際教育、公***管理 2014年7月學院官網顯示，學院擁有2所直屬附屬醫院，8所非直屬附屬醫院，實習醫院33所，高等醫學教育臨床教學基地11個所組成的醫學類實踐教學基地。依托規模較大、技術力量較強的醫藥企業、科研院所和植物資源保護區，建立了穩定的中藥學類、藥學類和營銷類專業實踐教學基地50余個，形成了數量充足、結構布局合理的多層次、多功能，能滿足學校開辦專業、確保教學質量的實踐教學基地。
附屬醫院分別是雲南中醫學院第壹附屬醫院雲南省中醫醫院、雲南中醫學院第二附屬醫院（籌）、雲南中醫學院第三附屬醫院昆明市中醫醫院、雲南中醫學院第四附屬醫院玉溪市中醫醫院、雲南中醫學院第五附屬醫院楚雄州中醫院雲南省彜醫醫院、雲南中醫學院第六附屬醫院西雙版納傣族自治州傣醫醫院、雲南中醫學院附屬醫院曲靖市中醫醫院 、雲南中醫學院附屬醫院昭通市中醫醫院 、雲南中醫學院附屬醫院開遠市人民醫院 、雲南中醫學院附屬醫院文山州中醫醫院 。
其中，第壹附屬醫院是雲南省唯壹省級中醫醫院，是由省內90家州、市、縣中醫院組成的雲南省中醫醫療集團的總醫院；第三附屬醫院是全國示範中醫醫院；第五附屬醫院是全國唯壹的彜醫醫院；第六附屬醫院是全國唯壹的傣醫醫院。
雲南中醫學院第二附屬醫院征地120畝隨學院壹同入駐呈貢大學城，將建設成為現代新昆明呈貢新區壹流的，集教學、醫療服務、預防、保健、康復、科學研究、保健養生等功能於壹體的中西醫結合綜合性三級甲等醫院。