據《中國醫藥物流行業深度調研與投資戰略規劃分析報告》 統計截至2009年年底，我國有醫藥物流企業1.3萬多家，行業呈現多、小、散、亂的格局。國藥、上藥、華潤北藥、九州通這四家醫藥物流企業行業排名前四，但在整個行業的份額不到30%。
中國醫藥市場前景光明，中國的藥價虛高根本原因在於中間環節過多，引入現代物流將會快速、高效、價廉地打造出豐厚的第三方利潤。
我國醫藥物流正處在起步發展的階段，很多做“醫藥物流”的人還沒有弄清楚到底什麽是物流。這說明從投資或經營的觀念上來看，人們對醫藥物流仍然存在壹些誤區。
國內醫藥物流現狀與發展趨勢
觀我國醫藥物流業的發展歷程，我國的醫藥物流還剛剛起步，尚未發展成熟，可以用“壹個特點、兩個趨勢、三個誤區、四個問題”來概括： 未來我國醫藥物流行業有兩個顯著的趨勢：壹是物流整合上升到企業戰略管理高度；二是物流服務與主營業務分開，實行專業化管理。
(1) 物流整合上升到企業戰略管理高度
現代醫藥物流運作方式將從傳統的批發模式向供應鏈管理模式發展，以物流中心為平臺，與制造商及其他供應商（上遊企業）和藥品零售商及其他分銷商（下遊企業）建立壹種面向市場的供應系統，提高藥品分銷效率，並形成相對穩定的產銷聯盟網絡。在這壹轉變過程中，物流管理在很多企業中已經從作業管理的層面上升到了企業戰略管理高度，被當作發展戰略的重要內容予以重視。形成這壹趨勢的原因有兩個：第壹是醫藥行業重組、整合的過程中，企業規模不斷擴大，而物流網絡是保障企業業務資源能夠有效整合，形成規模優勢的根本；第二是醫藥行業進入“微利時代”後，通過強化物流管理實現減本增效，以期在激烈的競爭中實現自身的成本優勢。
(2) 物流服務與主營業務分開，實行專業化管理
目前國內醫藥物流利潤率僅為0.6%－ 0.7%；費用率仍高達10%左右，就其原因就是因為傳統的物流模式運營成本太高，所以國內許多大型醫藥企業，例如上海國藥、上海醫藥、南京醫藥等，都把原有的物流業務、資產人員剝離或托管給第三方物流公司，並與第三方物流公司實行獨立結算、相互考核。形成這壹趨勢的主要原因有兩個：第壹，第三方物流公司的專業化運作可以有效地提高物流服務水平、降低物流成本，為母體創造可觀的經濟效益；第二，第三方物流公司在為母體提供物流服務的同時還可以利用剩余資源為社會上其它企業提供相似產品的物流服務。這對於初期投資巨大的醫藥物流項目而言，可以大大提高項目的投資回報率，實現集約化經營。可以預見到的是：在醫藥物流越來越受到重視的將來，我們將會看到越來越多這樣主輔分離、專業化運營的管理模式。 (1) 中小規模企業沒有必要也無法整合物流
據行業統計，全國藥品批發企業1.65萬家，零售企業近14萬家，全國零售藥店總數12萬家、藥品生產企業6300多家。這些企業中95%以上都是中小型醫藥企業，雖然中小型醫藥企業在投入上無法與大型企業相比，無法成為供應鏈整合的領導者，但是作為現行醫藥供應體系中的壹部分，任何壹個供應鏈的優化項目都離不開這壹環節。在中國醫藥供應鏈整合逐步受到重視的將來，任何壹個供應鏈中的成員也希望有這樣的戰略合作夥伴參與到項目中來，以***同探索成功之道。事實上，中小型醫藥企業可以在兩個層面上開展物流整合，以提高物流服務水平、降低物流成本。壹是在作業層面上，積極優化內部作業流程以提高效率和客戶服務水平，並探索與第三方醫藥物流企業的合作模式以取得成本降低；二是在戰略層面積極參與到大型企業領導的供應鏈整合中去，從上下遊環節取得成本降低和服務提高。
(2) 設備和技術決定競爭能力
認為物流設備、技術越先進就越有利於強化企業競爭力，越能吸引客戶和戰略合作夥伴，在物流項目的建設上重技術先進性帶來的宣傳效應，而輕視了系統應用中的協調壹致性，是當前國內醫藥物流投資的另壹誤區。這壹認識誤區的直接後果就是物流系統化、信息化、自動化不是為自己“量體裁衣”，與現有的業務規模和管理水平不匹配。事實上，作為壹項系統工程，物流效率和服務水平的高低不是取決於整個系統最強的部分，而是取決於最薄弱的環節。單壹技術環節的高要求、高投入並不能顯著改善整個物流系統的表現。從戰略投資者、商業合作夥伴或者是下遊的客戶的角度來說，更註重的是整個物流系統的可靠性、完整性和物流整體服務水平的高低，而不是物流設備、技術的先進程度。中國的醫藥物流要由傳統的粗放型向現代化的信息型轉變，存在著政策法規、業態流程、經營模式、觀念、軟件開發和人員這幾大障礙，這幾個主要的問題不解決，設備和技術再先進也無用武之地。
(3) 自動化帶來成本降低
自動化對降低物流成本的作用主要體現在兩個方面：壹是工作效率提高後帶來的直接人工成本降低，二是差錯率降低後帶來的間接作業成本降低。各地企業投資自動化物流中心的熱情很高，申報的項目少則投資數千萬元，多則高達數億元。然而國內的現狀是：壹方面企業在國營體制下很難裁減人員，進而降低人工成本，另壹方面自動化設備上馬後每天要產生數萬元的能耗成本。更有甚者，由於國內電力供應緊張的關系，很多自動化設備只能處於半投產狀態，無法通過規模化經營來降低成本。因此，很多企業面臨的困境是：自動化物流中心上馬後，物流成本不降反升。
導致上述原因的就是我國醫藥企業對自動化的片面認識。壹個先進的機械設備運行系統能否有效發揮作用，跟企業本身的信息化程度、信息化管理程度有很大的關聯，可是很多企業盲目的上信息化、物流機械化，沒有考慮是不是真正的適合自己企業的實際需求。事實上，我國的醫藥倉庫完全沒有必要上全自動的倉儲設備，國外之所以實現全自動化壹是因為他們的人工成本高，二是因為他們的其它的配套環境：政策、人才、業務流程達到這樣的水平。而這兩大條件在我國尚不存在，所以這種物流設備的“全副武裝”應該是壹個循序漸進的過程，當前只要針對自己的實際情況投入相應的設備就足夠了。 (1) 配套政策和標準不到位
對於第三方醫藥物流企業的審核制度仍然不明確。國家對江蘇、浙江等11個地區的成立醫藥物流中心給予貼息貸款等政策支持。這些整改的壹個必然結果就是醫藥的第三方物流企業從原有的醫藥批發企業中剝離出來，壹旦剝離就面臨對這些新的第三方物流企業進行資質考核和評估的問題。但是國家對這方面沒有壹個新的考核和評估體系，而原有的GSP認證只是適合醫藥經銷企業的，對於第三方醫藥物流企業GSP的很多內容都不再適用。壹個新的考核、評估體系的制定迫在眉睫。
此外，國家還沒有出臺統壹的藥品編碼。統壹編碼可以建立起壹套對藥品質量全程跟蹤和追究制度，但是長期以來，由於藥品的品種較多，國家沒有統壹編碼，藥品名稱復雜，有中文名、商品名、英文名、拉丁名等。這給生產企業、醫院，尤其給大型連鎖藥店帶來很多的麻煩。這種各家自成體系的編碼，在信息流通中既不能實現信息***享，也不利於對藥品的監管，從而造成了資源的極大浪費。另外物流標準的不統壹也成為制約我國醫藥物流向規範化、高效化並與國際接軌的壹大障礙。比如藥品物流容器、藥品包裝箱、藥品倉儲托盤等缺乏統壹的標準。因此必須加快推進醫藥物流標準化的建設。同時，調整醫藥物流配送中心的許可證制度和經營對象範圍，應與國際接軌，建立配送中心嚴格準入許可證制度，建立配送中心下屬的配送分中心的許可證備案制度。
(2) 投資過熱、過散，缺乏有效整合
從2002年7月北京醫藥股份與國際著名物流設計生產制造企業西門子德馬泰克正式簽約，合作建立現代化醫藥物流配送中心之後，全國各地廣泛掀起了興建大型醫藥物流中心的熱潮。目前國內銷售額最大的中國醫藥集團、上海醫藥股份公司、九州通集團有限公司也分別僅占醫藥市場銷售總額的3%～5%左右，與此同時這些醫藥物流企業在物流建設中均以單個企業為主體，呈現點多、規模大、投資大的狀況。設計規模要求往往是企業現有業務規模的3到5倍，動輒要求能夠支持上百億元的銷售。然而，由於國內醫藥行業供應鏈整合的環境還沒有形成，第三方醫藥物流也不成熟，各搞壹塊、重復投資的結果就是各家都吃不飽、很難形成規模效應。
與美國相比，平均每個配送中心能夠支撐的消費額，我國只是美國的11.75%；配送中心內每平方米能夠支持的銷售額，我國只是美國的40%；平均每個配送中心能夠支持的SKU品種規格，我國也只是美國的24%；而平均處理單行訂單的運作成本，我國卻是美國的2.78倍。由於銷售額小、效率低，所以經營會處於困難境地。前壹段時間在九省通衢的武漢，有四家已建和在建的醫藥物流中心，其中壹家物流中心已明顯業務不足，陷入虧損的困境。
(3) 第三方物流不成熟
由於剝離出來的醫藥物流企業沒有經歷壹個第三方物流企業的壹般發展過程，存在很多的第三方物流能力的不足。第壹，配送網絡單壹，配送網絡主要從以前的藥品進、銷的路線和節點演化，分布不合理，沒有從第三方物流系統規劃配送網絡的角度設計。第二，信息化能力低下，醫藥物流信息化建設落後，還沒有壹個適應國內市場的成熟的信息化方案。許多企業還沒有能力利用信息化來提高效率。第三，醫藥物流企業采用的是倉庫、車輛和人員的堆積方式，實現以人工為主的商品儲運，人員素質不高，當面對更大的商品吞吐，效率、速度、準確與成本等因素對發展造成影響。據有關統計，目前國內醫藥商業的平均物流成本占銷售額的比重達10%以上，而美國醫藥批發商的該項指標僅為2.6%；醫藥商業純利潤率僅有0.72%，全美醫藥批發商利潤率為1.55%。因此物流手段與發達國家相比還有不小的差距。
(4) 專業管理人才缺乏
目前有業內專家估計，能夠真正稱得上醫藥高級物流人才的僅超過百人。當前全國急需高級醫藥物流人才2,000人左右，這也就是說社會上醫藥物流人才的比例不足總需求量的1/20，並且隨著醫藥物流的持續升溫，這個差距還會懸殊。造成醫藥物流專業人才的缺乏主要原因有三個方面：第壹，由於很多的醫藥企業對物流的認識還只停留在淺層次的模糊概念上，以至於很多管理都認為醫藥物流不過是醫藥運輸與倉儲的簡單相加。在這種觀念指導下，使這些對物流認識本身就壹知半解的高層管理者們錯誤地認為: 高薪聘請醫藥人才還不如多找些倉庫保管員和貨物運輸員，因此許多所謂的物流人才實際上只是些操作工而已。這就導致人才供給被假性擴大，從而真正意義上的，對復合型物流人才、戰略型人才的需求就不像原本那麽強烈，這是不利於醫藥物流復合型人才培養的。第二，由於在整個物流人才管理過程中還存在著種種疏漏，從而導致物流人才存在直接或間接的流失，比如傳統的醫藥物流薪酬激勵作用不大，員工的培養計劃根本沒有或者有但是不成熟等等。第三，部門整合不徹底。物流部門作為壹個協調生產與銷售的服務部門，往往其成員所做出的戰略決策是針對企業若幹職能部門的，所以物流人員的積極性就很大程度上取決於整個組織間的協調合作。