1.打開國家稅務總局網站，點擊“納稅服務”標簽。
2.在“稅務服務”標簽下，點擊“網上稅務服務”選項。
3.進入“網上辦稅”頁面後，點擊頁面左側的“納稅申報”按鈕，然後點擊“進入納稅區域”；
4.在出現的對話框中，輸入納稅人識別號和密碼後，進入辦稅大廳，申報納稅；
5.填寫增值稅納稅申報表主表、附表及其他附頁材料；
6.提交完成的報告，系統將自動檢查提交的數據。如有錯誤，系統會提示，然後根據提示修改；
7.如果沒有錯誤，系統會提示申報成功，然後提示扣款。如果扣款成功，則完成網上申報。
增值稅基礎
增值稅的計稅依據如下:
1.納稅人出租、出借包裝銷售貨物收取的保證金應單獨核算，不得並入營業稅。但對因逾期回收包裝物而未退還的保證金，按照包裝物的適用稅率征收增值稅；
2.納稅人以打折的方式銷售商品。同壹張發票上分別註明銷售額和折扣額的，可以按照折扣後的銷售額征收增值稅；折扣金額單獨開票的，無論財務如何處理，折扣金額均不得從銷售金額中扣除；
3.納稅人以以舊換新方式銷售貨物，應按照同期新品銷售價格確定銷售額。納稅人采用還本方式銷售貨物，不得從銷售額中扣除還本金額。
4.如果納稅人因銷售價格明顯偏低或無銷售價格，需要形成應稅價值來確定銷售額，則組價公式中的成本利潤率為10%。但是，對於應當按固定價格率征收消費稅的貨物，組價公式中的成本利潤率是《關於消費稅若幹具體問題的規定》中規定的成本利潤率。
增值稅專用發票使用規定
1，所有小規模納稅人都可以自己開專用票。增值稅小規模納稅人(其他個人除外)發生增值稅應稅行為需要開具增值稅專用發票的，可自願使用增值稅發票管理系統自行開具。選擇自行開具增值稅專用發票的小規模納稅人，稅務機關不再開具增值稅專用發票；
2、取消認證期限:
(1)增值稅壹般納稅人取得2017 1日及以後開具的增值稅專用發票、海關進口增值稅專用繳款書、機動車銷售統壹發票、收費公路通行費增值稅電子普通發票，取消認證、審核比對、申報抵扣時限。也就是說，不受360天認證確認、審核比對、申報扣費的要求；
(二)已取得增值稅專用發票、增值稅進口專用海關繳款書、2月316+06+31日及以前開具的機動車銷售統壹發票的增值稅壹般納稅人，超過認證、審核比對、申報抵扣時限的，仍可按有關規定繼續抵扣進項稅額。
3.六種情況下增值稅發票將納入異常憑證管理:
(1)納稅人丟失或被盜專用稅控設備未開具或已開具未上傳的增值稅專用發票；
(二)未向稅務機關申報或者未按規定納稅的非正常納稅人的增值稅專用發票；
(三)增值稅發票管理系統審核比對發現“不符”、“缺失”、“無效”的增值稅專用發票；
(4)根據國家稅務總局和省稅務局大數據分析，發現納稅人開具的增值稅專用發票涉嫌虛開、未按規定繳納消費稅；
(五)商業企業購銷商品名稱嚴重偏離的；生產企業無實際生產加工能力且無委托加工，或者生產能耗與銷售情況嚴重不符，或者采購的商品不能直接生產其銷售的商品且無委托加工的；
(6)直接逃避失蹤人員不納稅申報，或者通過填寫增值稅納稅申報表相關欄目進行虛假申報，逃避稅務機關的審核比對。
4、收費公路通行費電子票據的發放
(1)etc後付費客戶索要發票的，可通過經營性收費公路部分，在發票服務平臺上獲取收費公路經營單位開具的稅務發票；通過政府還貸收費公路部分，在發票服務平臺上取得ETC客服機構臨時開具的免稅發票；
(2)ETC預付費客戶可以選擇充值後索要發票，也可以選擇實際過路費後索要發票。
法律依據:《中華人民共和國增值稅暫行條例》第九條。
納稅人購進貨物、勞務、服務、無形資產和不動產，取得的增值稅抵扣憑證不符合法律、行政法規或者國務院稅務主管部門有關規定的，不得從銷項稅額中抵扣進項稅額。
第十條
下列項目的進項稅額不得從銷項稅額中扣除:
(壹)為簡易計稅項目、免征增值稅的項目、集體福利或者個人消費購買的貨物、勞務、服務、無形資產和不動產；
(二)外購商品以及相關勞務和運輸服務的非正常損失；
(3)非正常損失的在產品和產成品耗用的購進貨物(不含固定資產)、勞務和運輸勞務；
(四)國務院規定的其他項目。