壹、直線型組織結構模式
在軍隊組織體系中，組織紀律非常嚴格。軍、師、旅、團、營、連、排、班的組織關系是指令逐級下達，第壹指揮級和第壹級對第壹級負責。直線型組織結構來源於這種非常嚴謹的軍事組織體系。
在線性組織結構中，每個工作部門只能向其直接下屬部門下達工作指令，每個工作部門只有壹個直接上級部門。因此，每個工作部門只有壹個指令源，避免了相互矛盾的指令對組織系統運行的影響。
在國際上，直線型組織結構模式是建設項目管理組織體系的壹種常見模式，因為壹個建設項目的參與單位很多，少則幾十個，多則幾百個，大型項目會有上千個參與單位。在項目實施過程中，相互矛盾的指令會對項目目標的實現產生很大影響，而直線型組織結構模式可以保證工作指令的唯壹性。
但在超大型組織體系中，直線型組織結構模型的指令路徑過長，可能會在壹定程度上造成組織體系運行的困難。
二、職能型組織結構模式
在壹般工業企業中，有管理人、財、物和產、供、銷的職能部門，也有生產車間和後勤保障機構。雖然生產車間和後勤保障機構不壹定是職能部門的直接下屬部門，但職能管理部門可以在其管理職能範圍內向生產車間和後勤保障機構下達工作指令，這是典型的職能型組織結構。
高校內設有管理人事、財務、教學、科研和基本建設的職能部門(辦公室)，以及學院、系、研究中心等其他教學科研機構。他們的組織結構模式也是職能制組織結構，人事部門和教務處可以在各自的職責範圍內向學院和院系下達工作指令。
目前，我國大部分企業、學校、事業單位仍在使用這種傳統的組織結構模式。許多建設項目仍然采用這種傳統的組織結構模式，工作中經常出現重疊和矛盾的工作順序，嚴重影響了項目管理機制的運行和項目目標的實現。
三、矩陣式組織結構模式
矩陣式組織結構是壹種較新的組織結構模式。在矩陣式組織結構的最高指揮官(部門)之下，有兩種不同類型的工作部門，縱向和橫向。垂直工作部門如人、財、物、產、供、銷職能管理部門，水平工作部門如生產車間。
如果施工企業采用矩陣式組織結構，縱向工作部門可以是計劃管理、技術管理、合同管理、財務管理、人事管理，橫向工作部門可以是項目部。
大型建設項目如果采用矩陣式組織結構模式，縱向工作部門可以是投資控制、進度控制、質量控制、合同管理、信息管理、人事管理、財務管理、物資管理，橫向工作部門可以是各個子項目的項目管理部門。
矩陣式組織結構適用於大型組織系統，上海地鐵和廣州地鐵1號線的建設都采用了矩陣式組織結構模式。