澱粉酶-澱粉酶水解澱粉產生糊狀麥芽低聚糖和麥芽糖。主要由枯草芽孢桿菌和地衣芽孢桿菌深層發酵產生，後者產生耐熱酶。此外，它還由曲黴屬和根黴屬的液體深層和半固體發酵生產，適用於食品加工。-澱粉酶主要用於制糖、紡織退漿、發酵原料處理和食品加工。糖化酶能將澱粉水解成葡萄糖，現在幾乎全部由黑曲黴深層發酵生產，用於制糖、酒精生產、發酵原料處理等。
蛋白酶使用的菌株最多，產生的品種也最多。地衣芽孢桿菌、短小芽孢桿菌和枯草芽孢桿菌通過深層發酵生產細菌蛋白酶；鏈黴菌和曲黴深層發酵生產中性蛋白酶和曲黴酸性蛋白酶，用於皮革脫毛、毛皮軟化、醫藥和食品工業。凝乳酶是由壹些毛黴屬細菌半固態發酵產生的，在制作奶酪時代替了最初從小牛胃中提取的凝乳酶。
葡萄糖異構酶是20世紀70年代迅速發展起來的壹個品種。鏈黴菌細胞通過深層發酵獲得。固定化後的葡萄糖溶液轉化為含有約50%果糖的糖漿，可替代蔗糖用於食品工業。利用澱粉酶、糖化酶和葡萄糖異構酶將玉米澱粉制成糖漿已成為新興的制糖工業之壹。
其他重要的工業用酶包括:曲黴和木黴半固體發酵產生的纖維素酶；曲黴產生的果膠酶和半纖維素酶；曲黴和青黴深層發酵產生葡萄糖氧化酶和過氧化氫酶；假絲酵母和曲黴深層發酵產脂肪酶:糖化酶、葡萄糖氧化酶、過氧化氫酶、脂肪酶、乳糖酶等。由黑曲黴深層或半固體發酵產生；米曲黴產生的澱粉酶、蛋白酶和核糖核酸酶；芽孢桿菌產生的蛋白酶和α-澱粉酶。
中國從1964開始生產細菌澱粉酶。目前主要有-澱粉酶(枯草芽孢桿菌)、蛋白酶(芽孢桿菌、曲黴、鏈黴菌)、糖化酶(黑曲黴)等酶制劑，以及固定化技術生產的脂肪酶(假絲酵母)、葡萄糖氧化酶(青黴)、天冬酰胺酶(大腸桿菌)和葡萄糖異構酶(鏈黴菌)、青黴素酰化酶、天冬氨酸酶和多核苷酸磷酸化酸化。