APOE基因檢測，又稱載脂蛋白E基因檢測，APOE是apolipoproteinE的縮寫，翻譯過來就是載脂蛋白E，它是壹種多態性蛋白，參與脂蛋白的轉化與代謝過程，其基因可以調節許多生物學功能，與許多眼科疾病發病有關，對ApoE及其基因多態性的研究是醫學研究的熱點之壹，探討兩者之間的內在聯系，對眼病的預防、診斷及治療具有重要的臨床應用價值。
二、APOE基因檢測的意義
在臨床上通過APOE基因檢測主要是針對於載脂蛋白e基因的檢測，壹般可將患者分為E2、E3、E4三個表現型，每個表現型在不同的疾病的發生率上都有不同的特點。
我國大多數人群屬於E3表現型，屬於相對較為均衡的類型。E4表現型患者出現動脈粥樣硬化、冠狀動脈粥樣硬化性心臟病和癡呆的風險相對比較低，黃斑變性導致視力損害的可能性相對較高。E2表現型患者幾乎不太可能出現黃斑變性，但是出現癡呆和冠心病的風險相對反而過高。
三、APOE基因檢測的方法
APOE基因檢測既可以以VLDL為樣品，又可以直接以血清（或血漿）為樣品，通過IEF電泳分析、雙向PAGE或結合免疫印跡法進行測定：
1、等電聚焦法（IEF）
由於三種主要ApoE異構體E2、E3和E4的等電點（pⅠ）分別為5.89、6.02和6.68，E4比E3多壹個正電荷，而E2比E3少壹個正電荷。因此，可應用1EF檢測這些異構體間電荷差異而確定不同ApoE表型。傳統ApoE表型檢測方法多采用超速離心法或化學沈澱法分離VLDL，脫脂後進行IEF，然後進行染色分析。這種方法需要血清量較多，昂貴、費時，又需要大型設備，不適合大規模研究。ApoE異構體之間染色程度之間差異及電泳過程中泳動距離的變異性也造成結果的不穩定性。
2、雙相電泳法（two-dimensionalelectrophoresis）
第壹相應用IEF電泳將等電點不同的蛋白質分離；第二相根據蛋白質分子量不同及濃度的差異，應用SDS-PAGE進行分離，由此確定ApoE表型。此技術能解決IEF遇到的壹些轉錄後修飾的問題，臨床標本用量也很少，並且可以同時進行定性和定量分析，但由於成本昂貴而且費時，有時也難以清晰地分辨表型，故臨床上應用較少。
3、免疫印跡法（immunoblotting）
血清脫脂後，經IEF電泳將ApoE與其他蛋白質分離，然後將凝膠中蛋白質轉移到硝酸纖維素（NC）膜上，用抗ApoE抗體作為壹抗進行免疫印跡反應或采用直接的免疫固定法，即可靈敏而特異地顯示出ApoE區帶的位置，從而確定ApoE表型。此方法利用抗原-抗體的特異反應，排除了血清其他蛋白質的幹擾，不需超速離心分離VLDL，血清用量少，是國內外實驗室檢測ApoE表型常用的方法之壹。但此類方法亦存在壹些缺點，如對於存在與普遍異構體具有相同電荷的罕見異構體標本，或在糖尿病等病理狀態時，由於轉錄後修飾引起蛋白質變化的標本檢測時，就會給出錯誤的結果。