六種育種方法包括植物的四種（雜交育種、遠緣雜交、誘變育種、分子育種）和動物的兩種（雜交育種、基因工程育種）。
壹、雜交育種：
1、原理：基因重組，通過基因重組產生新的基因型，從而產生新的優良性狀。
2、過程：
2.1雜交前的準備工作首先要熟悉各種魚類的生殖習性；
2.2選擇適當的受精方法進行雜交雜交前期在臨近性成熟和生殖季節到來之時，壹定要將雌雄兩種魚分池飼養，避免自 *** 配；
2.3記載、掛牌和管理用不同品種(或種)的魚類進行雜交；
2.4加速育種進程從雜交到新品種育成推廣；
2.5雜交後代的選擇采用個體選擇法時，選擇壹般從子二代開始，因子二代變異範圍最大，可望從中選出合意的變異體。
3、優點：可以將兩個或多個優良性狀集中在壹起。
4、缺點：不會產生新基因，且雜交後代會出現性狀分離，育種過程緩慢，過程復雜。
二：遠緣雜交
1、原理：基因重組，通過基因重組產生新的基因型，從而產生新的優良性狀。
2、優缺點：可以把不同種、屬的特征、特性結合起來，突破種屬界限，擴大遺傳變異，從而創造新的變異類型或新物種。
產生的後代為遠緣雜種。
由於遠緣雜交往往重演物種的進化的歷程，故也是研究生物進化的重要實驗手段。
遠緣雜交壹般不易結實，即使結實，雜種也通常不育或夭亡，雜種後代分離幅度大，分離世代長且不易穩定。
三：誘變育種
1、原理：在人為的條件下，利用物理、化學等因素，誘發生物體產生突變，從中選擇，培育成動植物和微生物的新品種。
2、優缺點：誘變育種存在的主要問題是有益突變頻率仍然較低，變異的方向和性質尚難控制。
因此提高誘變效率，迅速鑒定和篩選突變體以及探索定向誘變的途徑，是當前研究的重要課題。
四：分子育種
1、原理：將基因工程應用於育種工作中，通過基因導入，從而培育出壹定要求的新品種的育種方法。
2、優缺點：傳統育種方法屬於雜交育種，品種改良主要受種原變異之限制，而不同物種(species) 間之雜交頗為困難，育種成果難有大突破，「綠色革命」(green revolution) 很難再發生。
利用基因工程技術進行作物品種改良，系指以遺傳工程(geic engineering) 技術，將特定基因或性狀導入缺乏此基因或特性之目標作物(target crop) 的育種方法；因此利用基因工程技術進行作物品種改良，可以突破種原之限制及種間雜交之瓶頸，創造新性狀或新品種，亦即未來「基因革命」(gene revolution) 很可能迅速取代「綠色革命」。
五、基因工程育種
1、原理：基因重組(或異源DNA重組)。
2、優缺點：不受種屬限制，可根據人類的需要，有目的地進行。
可能會引起生態危機，技術難度大。